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SeeDB Resources

  • SeeDB Resources SeeDB, SeeDB2などの透明化法の情報サイト。プロトコルやTIPs、動画など。細かい情報をアップデートしています。

SeeDB YouTube: [YouTube(1)] [YouTube(2)] [YouTube(3)]

SeeDB2 YouTube:  [YouTube(1)] [YouTube(2)][YouTube(3)]

SeeDBは和光純薬からも市販されています。

 

NeuroMorph.org (神経細胞形態データ)

透明化脳を使って取得した神経細胞の形態データ(Neurolucidaによる再構築データ)は、論文発表後、NeuroMorph.Orgにデポジットしています。Browse > By Archive > Imaiで閲覧できます(こちら)。(Ke et al., 2013; Ke et al., 2016; Murai et al., 2016)

 

SSBD (顕微鏡画像生データ)

当研究室から発表した論文の画像データ(生データ)はSystems Science of Biological Dynamics (SSBD) データベースにデポジットしています。自由に閲覧、ダウンロード、再使用可能です。

Ke et al., Nature Neuroscience (2013)

Ke et al.,  Cell Reports (2016)

Iwata et al., Neuron (2017)

 

Addgene (プラスミド)

Takeshi Imai Lab Plasmids

GitHub (解析コード)

準備中です。

 

Protocols

Optical Clearing using SeeDB/SeeDB2 (Ke et al., 2013; Ke et al., 2016)

日本語の解説とプロトコル(簡易版)はこちら

Single-cell microarray (Imai et al., 2009)

 

Single-cell cDNA library (Imai et al., 2006)

Single cell cDNA library (簡易法)

 

Two-color in situ hybridization (Imai et al., 2006; Imai et al., 2009)

 

その他

 

特許

  • 出願番号: 2012-141488 PCT/JP2011/056502 (特許番号 5967528) 発明の名称:生物材料を透明化する方法および生物材料用透明化処理キット Google Patents
  • 出願番号: 2015-55325 PCT/JP2016/55229 発明の名称:生物材料の観察方法および透明化方法 Google Patents

 

Mice

※不明な点についてはお気軽にメールにてお問い合わせください。
共同研究も歓迎いたします。